MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4701

Total Repeats: 445

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014131	TAT	2	6	38	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014131	GCT	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014131	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014131	TAC	2	6	216	221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014131	TTA	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014131	TTG	2	6	338	343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014131	AAC	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014131	TTA	2	6	392	397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014131	CTTA	2	8	455	462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014131	GAA	3	9	468	476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014131	GATATT	2	12	589	600	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014131	AGC	2	6	684	689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014131	TGA	2	6	714	719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014131	A	6	6	776	781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014131	CAT	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014131	AT	3	6	821	826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014131	TTACTT	2	12	848	859	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014131	ATA	2	6	890	895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014131	AT	3	6	901	906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014131	AGA	2	6	956	961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014131	AGT	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014131	ATT	2	6	990	995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987466
23	NC_014131	TTA	3	9	1077	1085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987466
24	NC_014131	AAAG	2	8	1167	1174	75 %	0 %	25 %	0 %	295987466
25	NC_014131	CTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295987466
26	NC_014131	TA	4	8	1211	1218	50 %	50 %	0 %	0 %	295987466
27	NC_014131	GTAC	2	8	1248	1255	25 %	25 %	25 %	25 %	295987466
28	NC_014131	ATC	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987466
29	NC_014131	AT	3	6	1295	1300	50 %	50 %	0 %	0 %	295987466
30	NC_014131	AAG	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987466
31	NC_014131	ATA	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987466
32	NC_014131	T	7	7	1375	1381	0 %	100 %	0 %	0 %	295987466
33	NC_014131	ATA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987466
34	NC_014131	TAAAAA	2	12	1481	1492	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	295987466
35	NC_014131	A	7	7	1488	1494	100 %	0 %	0 %	0 %	295987466
36	NC_014131	CTAATT	2	12	1525	1536	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295987466
37	NC_014131	A	6	6	1545	1550	100 %	0 %	0 %	0 %	295987466
38	NC_014131	TAG	2	6	1586	1591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987466
39	NC_014131	TAAAA	2	10	1651	1660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014131	GAA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987467
41	NC_014131	ATG	2	6	1776	1781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987467
42	NC_014131	AGA	2	6	1805	1810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987467
43	NC_014131	AT	3	6	1815	1820	50 %	50 %	0 %	0 %	295987467
44	NC_014131	ATA	2	6	1852	1857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987467
45	NC_014131	AAT	2	6	1980	1985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987467
46	NC_014131	TA	6	12	1998	2009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014131	T	7	7	2048	2054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014131	ATTG	2	8	2142	2149	25 %	50 %	25 %	0 %	295987468
49	NC_014131	TGA	2	6	2208	2213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987468
50	NC_014131	AGT	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987468
51	NC_014131	ATA	2	6	2336	2341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987468
52	NC_014131	T	6	6	2346	2351	0 %	100 %	0 %	0 %	295987468
53	NC_014131	AGA	2	6	2376	2381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987468
54	NC_014131	AT	3	6	2388	2393	50 %	50 %	0 %	0 %	295987468
55	NC_014131	GAATT	2	10	2411	2420	40 %	40 %	20 %	0 %	295987468
56	NC_014131	AAT	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987468
57	NC_014131	AAACA	2	10	2459	2468	80 %	0 %	0 %	20 %	295987468
58	NC_014131	A	6	6	2569	2574	100 %	0 %	0 %	0 %	295987469
59	NC_014131	AAT	2	6	2587	2592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987469
60	NC_014131	TGAA	2	8	2649	2656	50 %	25 %	25 %	0 %	295987469
61	NC_014131	ATTG	2	8	2674	2681	25 %	50 %	25 %	0 %	295987469
62	NC_014131	AAG	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987469
63	NC_014131	AAT	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987469
64	NC_014131	TGA	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987469
65	NC_014131	GAT	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987469
66	NC_014131	ACA	2	6	3031	3036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987469
67	NC_014131	TGTT	2	8	3059	3066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014131	GGGA	2	8	3090	3097	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014131	GA	4	8	3111	3118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014131	TGA	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014131	GA	3	6	3144	3149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014131	A	8	8	3251	3258	100 %	0 %	0 %	0 %	295987470
73	NC_014131	ACCA	2	8	3266	3273	50 %	0 %	0 %	50 %	295987470
74	NC_014131	GCT	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987470
75	NC_014131	TGAA	2	8	3462	3469	50 %	25 %	25 %	0 %	295987470
76	NC_014131	TCT	2	6	3569	3574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295987470
77	NC_014131	TTG	2	6	3807	3812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295987470
78	NC_014131	AGC	2	6	3819	3824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987470
79	NC_014131	T	6	6	4037	4042	0 %	100 %	0 %	0 %	295987470
80	NC_014131	TCC	2	6	4102	4107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295987471
81	NC_014131	TGAC	2	8	4155	4162	25 %	25 %	25 %	25 %	295987471
82	NC_014131	GCTT	2	8	4183	4190	0 %	50 %	25 %	25 %	295987471
83	NC_014131	CTT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295987471
84	NC_014131	T	7	7	4362	4368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014131	CTA	2	6	4414	4419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014131	CTTT	2	8	4437	4444	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014131	TTCT	2	8	4523	4530	0 %	75 %	0 %	25 %	295987472
88	NC_014131	GTTT	2	8	4577	4584	0 %	75 %	25 %	0 %	295987472
89	NC_014131	T	6	6	4582	4587	0 %	100 %	0 %	0 %	295987472
90	NC_014131	AAC	2	6	4599	4604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987472
91	NC_014131	AAT	2	6	4688	4693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014131	TAT	2	6	4706	4711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014131	ATT	2	6	4728	4733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014131	CCG	2	6	4843	4848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014131	ATA	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014131	AGG	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014131	GAG	2	6	5031	5036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014131	GAA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
99	NC_014131	T	6	6	5322	5327	0 %	100 %	0 %	0 %	295987473
100	NC_014131	A	7	7	5365	5371	100 %	0 %	0 %	0 %	295987473
101	NC_014131	CGT	2	6	5435	5440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987473
102	NC_014131	TGA	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987473
103	NC_014131	AAG	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
104	NC_014131	A	6	6	5537	5542	100 %	0 %	0 %	0 %	295987473
105	NC_014131	TGC	2	6	5545	5550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987473
106	NC_014131	A	6	6	5613	5618	100 %	0 %	0 %	0 %	295987473
107	NC_014131	A	6	6	5642	5647	100 %	0 %	0 %	0 %	295987473
108	NC_014131	AT	3	6	5776	5781	50 %	50 %	0 %	0 %	295987473
109	NC_014131	GAA	2	6	5843	5848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
110	NC_014131	AGA	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
111	NC_014131	GAAA	2	8	5948	5955	75 %	0 %	25 %	0 %	295987473
112	NC_014131	AACAGC	2	12	5986	5997	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	295987473
113	NC_014131	TATGC	2	10	6003	6012	20 %	40 %	20 %	20 %	295987473
114	NC_014131	GAA	2	6	6099	6104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
115	NC_014131	CTCA	2	8	6105	6112	25 %	25 %	0 %	50 %	295987473
116	NC_014131	A	6	6	6117	6122	100 %	0 %	0 %	0 %	295987473
117	NC_014131	GAC	2	6	6149	6154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987473
118	NC_014131	TAGAT	2	10	6191	6200	40 %	40 %	20 %	0 %	295987473
119	NC_014131	AATC	2	8	6227	6234	50 %	25 %	0 %	25 %	295987473
120	NC_014131	TCA	2	6	6339	6344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014131	TAA	2	6	6371	6376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014131	CAC	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014131	TGTTT	2	10	6474	6483	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014131	T	6	6	6481	6486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014131	ATTG	2	8	6487	6494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014131	TAT	2	6	6512	6517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014131	TAT	2	6	6572	6577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014131	A	7	7	6604	6610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014131	A	7	7	6626	6632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014131	A	7	7	6648	6654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014131	AAAT	2	8	6678	6685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014131	CAA	2	6	6754	6759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014131	AC	3	6	6818	6823	50 %	0 %	0 %	50 %	295987474
134	NC_014131	GTC	2	6	6849	6854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987474
135	NC_014131	ATA	2	6	6859	6864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987474
136	NC_014131	T	7	7	6995	7001	0 %	100 %	0 %	0 %	295987474
137	NC_014131	AATGAT	2	12	7008	7019	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295987474
138	NC_014131	A	6	6	7048	7053	100 %	0 %	0 %	0 %	295987474
139	NC_014131	T	7	7	7067	7073	0 %	100 %	0 %	0 %	295987474
140	NC_014131	A	6	6	7080	7085	100 %	0 %	0 %	0 %	295987474
141	NC_014131	CTTA	2	8	7192	7199	25 %	50 %	0 %	25 %	295987474
142	NC_014131	AGTA	2	8	7257	7264	50 %	25 %	25 %	0 %	295987474
143	NC_014131	AAT	2	6	7268	7273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987474
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147	NC_014131	GCA	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987474
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149	NC_014131	GAT	2	6	7593	7598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987474
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153	NC_014131	AT	3	6	7823	7828	50 %	50 %	0 %	0 %	295987474
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407	NC_014131	TGA	2	6	19529	19534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987483
408	NC_014131	GGAT	2	8	19539	19546	25 %	25 %	50 %	0 %	295987483
409	NC_014131	A	7	7	19610	19616	100 %	0 %	0 %	0 %	295987483
410	NC_014131	TGG	2	6	19646	19651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295987483
411	NC_014131	GAA	2	6	19706	19711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
412	NC_014131	AAATA	2	10	19717	19726	80 %	20 %	0 %	0 %	295987484
413	NC_014131	CAA	2	6	19846	19851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987484
414	NC_014131	ACT	2	6	19863	19868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987484
415	NC_014131	TAA	2	6	19898	19903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987484
416	NC_014131	GGA	2	6	19910	19915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295987484
417	NC_014131	ACA	2	6	19925	19930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987484
418	NC_014131	A	6	6	19945	19950	100 %	0 %	0 %	0 %	295987484
419	NC_014131	ATG	3	9	19957	19965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987484
420	NC_014131	CCAA	2	8	19995	20002	50 %	0 %	0 %	50 %	295987484
421	NC_014131	ATG	2	6	20101	20106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987484
422	NC_014131	GCA	2	6	20142	20147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987484
423	NC_014131	TA	3	6	20161	20166	50 %	50 %	0 %	0 %	295987484
424	NC_014131	TGAAGT	2	12	20171	20182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987484
425	NC_014131	AAG	2	6	20209	20214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987484
426	NC_014131	GCAAT	2	10	20235	20244	40 %	20 %	20 %	20 %	295987484
427	NC_014131	T	7	7	20264	20270	0 %	100 %	0 %	0 %	295987484
428	NC_014131	TTA	2	6	20272	20277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987484
429	NC_014131	AATA	2	8	20280	20287	75 %	25 %	0 %	0 %	295987484
430	NC_014131	GAA	2	6	20349	20354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987484
431	NC_014131	TAT	2	6	20466	20471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987485
432	NC_014131	AGA	3	9	20496	20504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987485
433	NC_014131	TA	3	6	20529	20534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_014131	AGG	2	6	20536	20541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
435	NC_014131	ATT	2	6	20570	20575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_014131	A	6	6	20624	20629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_014131	T	7	7	20697	20703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_014131	GA	3	6	20734	20739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
439	NC_014131	TAAA	2	8	20745	20752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_014131	A	8	8	20799	20806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_014131	CAA	2	6	20826	20831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_014131	GAA	2	6	20849	20854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_014131	TGA	2	6	20914	20919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
444	NC_014131	ATTA	2	8	20923	20930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_014131	TGA	2	6	21010	21015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.